MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthobacter autotrophicus Py2 chromosome

Total Repeats: 141852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009720	TTGCG	2	10	25	34	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009720	TCG	2	6	41	46	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009720	CTC	2	6	83	88	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009720	GC	3	6	177	182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009720	GCCG	2	8	269	276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009720	CG	3	6	275	280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009720	CCG	2	6	322	327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009720	GAATG	2	10	328	337	40 %	20 %	40 %	0 %	154243959
9	NC_009720	CGA	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
10	NC_009720	ACC	2	6	351	356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243959
11	NC_009720	CGTC	2	8	368	375	0 %	25 %	25 %	50 %	154243959
12	NC_009720	GAG	2	6	399	404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
13	NC_009720	CCG	2	6	448	453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
14	NC_009720	GAG	2	6	540	545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
15	NC_009720	GCG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
16	NC_009720	GCG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
17	NC_009720	CCCGT	2	10	592	601	0 %	20 %	20 %	60 %	154243959
18	NC_009720	GGT	2	6	629	634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
19	NC_009720	CAG	2	6	672	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
20	NC_009720	CGG	2	6	766	771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
21	NC_009720	C	6	6	814	819	0 %	0 %	0 %	100 %	154243959
22	NC_009720	CG	3	6	824	829	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
23	NC_009720	GTG	2	6	849	854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
24	NC_009720	CGC	3	9	878	886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
25	NC_009720	CGGC	2	8	1010	1017	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
26	NC_009720	CAC	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243959
27	NC_009720	CCG	2	6	1033	1038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
28	NC_009720	GCC	2	6	1062	1067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
29	NC_009720	CGA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
30	NC_009720	CAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154243959
31	NC_009720	CAG	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
32	NC_009720	CTG	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
33	NC_009720	CGG	2	6	1202	1207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
34	NC_009720	GGT	3	9	1214	1222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
35	NC_009720	GGC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
36	NC_009720	CGA	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
37	NC_009720	CGG	2	6	1286	1291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243959
38	NC_009720	TGG	3	9	1294	1302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
39	NC_009720	GGA	3	9	1316	1324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243959
40	NC_009720	AGC	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
41	NC_009720	GC	3	6	1416	1421	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
42	NC_009720	GC	3	6	1453	1458	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
43	NC_009720	GCT	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
44	NC_009720	GCGGGT	2	12	1559	1570	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	154243959
45	NC_009720	GAC	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243959
46	NC_009720	GTG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
47	NC_009720	CG	4	8	1612	1619	0 %	0 %	50 %	50 %	154243959
48	NC_009720	CTG	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
49	NC_009720	GTG	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243959
50	NC_009720	GCC	2	6	1720	1725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243959
51	NC_009720	ACCAC	2	10	1741	1750	40 %	0 %	0 %	60 %	154243959
52	NC_009720	TGC	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243959
53	NC_009720	GTC	2	6	1855	1860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009720	GCCG	2	8	1921	1928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009720	CG	3	6	1962	1967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009720	GCG	3	9	1997	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009720	AGCC	2	8	2022	2029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009720	GC	3	6	2042	2047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009720	GGC	2	6	2052	2057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009720	TCC	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_009720	CGG	2	6	2086	2091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009720	GC	3	6	2135	2140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009720	ACG	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009720	CGG	2	6	2211	2216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009720	GC	3	6	2290	2295	0 %	0 %	50 %	50 %	154243960
66	NC_009720	CGT	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
67	NC_009720	GCG	2	6	2338	2343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
68	NC_009720	CGACCT	2	12	2413	2424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	154243960
69	NC_009720	GGT	2	6	2428	2433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243960
70	NC_009720	CCA	2	6	2469	2474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
71	NC_009720	GCCC	2	8	2479	2486	0 %	0 %	25 %	75 %	154243960
72	NC_009720	GGCG	2	8	2542	2549	0 %	0 %	75 %	25 %	154243960
73	NC_009720	CGG	2	6	2634	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
74	NC_009720	TGG	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243960
75	NC_009720	GAG	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
76	NC_009720	ATCT	2	8	2747	2754	25 %	50 %	0 %	25 %	154243960
77	NC_009720	CGG	2	6	2773	2778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
78	NC_009720	TGC	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
79	NC_009720	CGG	2	6	2844	2849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243960
80	NC_009720	CGGC	2	8	2853	2860	0 %	0 %	50 %	50 %	154243960
81	NC_009720	GCT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
82	NC_009720	GGA	2	6	2914	2919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
83	NC_009720	AGG	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243960
84	NC_009720	CCA	3	9	2949	2957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
85	NC_009720	CGC	3	9	3082	3090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243960
86	NC_009720	AGCG	2	8	3116	3123	25 %	0 %	50 %	25 %	154243960
87	NC_009720	CGGG	2	8	3124	3131	0 %	0 %	75 %	25 %	154243960
88	NC_009720	CCG	2	6	3225	3230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243960
89	NC_009720	CTG	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243960
90	NC_009720	CTGAA	2	10	3300	3309	40 %	20 %	20 %	20 %	154243960
91	NC_009720	CCA	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243960
92	NC_009720	CG	3	6	3439	3444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009720	CTG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009720	CGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
95	NC_009720	GGT	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
96	NC_009720	TCCT	2	8	3718	3725	0 %	50 %	0 %	50 %	154243961
97	NC_009720	CT	3	6	3724	3729	0 %	50 %	0 %	50 %	154243961
98	NC_009720	CCGG	2	8	3731	3738	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
99	NC_009720	GCG	2	6	3744	3749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
100	NC_009720	CG	3	6	3775	3780	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
101	NC_009720	GCC	2	6	3787	3792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
102	NC_009720	GCG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
103	NC_009720	GATG	2	8	3972	3979	25 %	25 %	50 %	0 %	154243961
104	NC_009720	GCC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
105	NC_009720	CGG	2	6	4006	4011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
106	NC_009720	GCGCT	2	10	4081	4090	0 %	20 %	40 %	40 %	154243961
107	NC_009720	GGA	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154243961
108	NC_009720	GC	3	6	4123	4128	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
109	NC_009720	GTGGCG	2	12	4168	4179	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	154243961
110	NC_009720	GCG	3	9	4177	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
111	NC_009720	CGC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
112	NC_009720	CGA	2	6	4233	4238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243961
113	NC_009720	TGGAGG	2	12	4313	4324	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	154243961
114	NC_009720	CCT	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243961
115	NC_009720	GCG	2	6	4369	4374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243961
116	NC_009720	CGC	2	6	4440	4445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
117	NC_009720	GC	3	6	4444	4449	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
118	NC_009720	TGG	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
119	NC_009720	GAC	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243961
120	NC_009720	GTG	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243961
121	NC_009720	CGC	2	6	4572	4577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243961
122	NC_009720	GC	3	6	4576	4581	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
123	NC_009720	GC	3	6	4616	4621	0 %	0 %	50 %	50 %	154243961
124	NC_009720	CGGG	2	8	4704	4711	0 %	0 %	75 %	25 %	154243961
125	NC_009720	CTC	2	6	4725	4730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009720	AAC	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009720	CTCC	2	8	4804	4811	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_009720	CAT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009720	AT	3	6	4824	4829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009720	CATA	2	8	4830	4837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009720	TAA	2	6	4839	4844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009720	GAC	2	6	4845	4850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009720	GGGA	2	8	4855	4862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009720	TGA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243962
135	NC_009720	CGG	3	9	4902	4910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
136	NC_009720	TGC	2	6	4968	4973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243962
137	NC_009720	CGG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
138	NC_009720	CCA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243962
139	NC_009720	GGC	2	6	5029	5034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
140	NC_009720	CGG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243962
141	NC_009720	CCTC	2	8	5064	5071	0 %	25 %	0 %	75 %	154243962
142	NC_009720	GAAGCT	2	12	5080	5091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154243962
143	NC_009720	CTG	2	6	5171	5176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243962
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153	NC_009720	CGA	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243962
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168	NC_009720	GCA	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_009720	GCA	2	6	6147	6152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_009720	CTGG	2	8	6155	6162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_009720	TCCCCG	2	12	6197	6208	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_009720	CG	3	6	6230	6235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_009720	TCA	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243963
174	NC_009720	CGG	2	6	6305	6310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243963
175	NC_009720	TCA	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243963
176	NC_009720	TCT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243963
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257	NC_009720	CAT	2	6	9481	9486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243966
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269	NC_009720	CAT	2	6	9948	9953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243967
270	NC_009720	ACG	2	6	10030	10035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243967
271	NC_009720	CG	3	6	10045	10050	0 %	0 %	50 %	50 %	154243967
272	NC_009720	GCG	2	6	10060	10065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243967
273	NC_009720	GGCGG	2	10	10066	10075	0 %	0 %	80 %	20 %	154243967
274	NC_009720	GCG	2	6	10132	10137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243967
275	NC_009720	TCC	2	6	10151	10156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243967
276	NC_009720	CGG	2	6	10187	10192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243967
277	NC_009720	CCG	2	6	10244	10249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243967
278	NC_009720	CAT	2	6	10281	10286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243967
279	NC_009720	GC	3	6	10288	10293	0 %	0 %	50 %	50 %	154243967
280	NC_009720	GGT	2	6	10335	10340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243967
281	NC_009720	TCC	2	6	10346	10351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154243967
282	NC_009720	CGG	3	9	10358	10366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243967
283	NC_009720	CAT	2	6	10383	10388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154243967
284	NC_009720	TGG	2	6	10398	10403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243967
285	NC_009720	CGC	2	6	10445	10450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_009720	CCG	2	6	10454	10459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_009720	CTTGG	2	10	10466	10475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_009720	CGC	2	6	10491	10496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_009720	TG	3	6	10505	10510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009720	GGC	2	6	10513	10518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_009720	GCC	2	6	10530	10535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_009720	TCC	2	6	10543	10548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_009720	GGA	2	6	10558	10563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_009720	GGTG	2	8	10568	10575	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
295	NC_009720	GGT	2	6	10589	10594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
296	NC_009720	CGG	2	6	10614	10619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243968
297	NC_009720	GAGG	2	8	10621	10628	25 %	0 %	75 %	0 %	154243968
298	NC_009720	GCTTGC	2	12	10632	10643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243968
299	NC_009720	CGGG	2	8	10644	10651	0 %	0 %	75 %	25 %	154243968
300	NC_009720	CCAG	2	8	10668	10675	25 %	0 %	25 %	50 %	154243968
301	NC_009720	CTG	2	6	10705	10710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243968
302	NC_009720	TGC	2	6	10718	10723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154243968
303	NC_009720	CG	3	6	10737	10742	0 %	0 %	50 %	50 %	154243968
304	NC_009720	GGT	2	6	10773	10778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243968
305	NC_009720	GCG	2	6	10797	10802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154243968
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310	NC_009720	CTT	2	6	10933	10938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154243968
311	NC_009720	TGG	2	6	10944	10949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243968
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349	NC_009720	TGG	2	6	12159	12164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243969
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357	NC_009720	CAGCG	2	10	12406	12415	20 %	0 %	40 %	40 %	154243969
358	NC_009720	GC	3	6	12427	12432	0 %	0 %	50 %	50 %	154243969
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362	NC_009720	GC	3	6	12541	12546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
363	NC_009720	CGT	2	6	12554	12559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
364	NC_009720	AT	3	6	12570	12575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
365	NC_009720	ATG	2	6	12581	12586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
366	NC_009720	CGG	2	6	12605	12610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
367	NC_009720	GGCA	2	8	12628	12635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
368	NC_009720	CCT	2	6	12661	12666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
369	NC_009720	CCG	2	6	12705	12710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243970
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372	NC_009720	GCC	2	6	12778	12783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243970
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380	NC_009720	TGG	2	6	13029	13034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154243970
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383	NC_009720	CGCC	2	8	13310	13317	0 %	0 %	25 %	75 %	154243971
384	NC_009720	GCC	2	6	13356	13361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243971
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389	NC_009720	GCC	2	6	13533	13538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243971
390	NC_009720	GCC	2	6	13549	13554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243971
391	NC_009720	CCA	2	6	13646	13651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243971
392	NC_009720	CCA	3	9	13664	13672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154243971
393	NC_009720	GCC	2	6	13734	13739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154243971
394	NC_009720	TGA	2	6	13748	13753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154243971
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396	NC_009720	CGA	2	6	13796	13801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154243971
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